MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes SLCC5850

Total Repeats: 66309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018592	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018592	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018592	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018592	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018592	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	404409240
6	NC_018592	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	404409240
7	NC_018592	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409240
8	NC_018592	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409240
9	NC_018592	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409240
10	NC_018592	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409240
11	NC_018592	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409240
12	NC_018592	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404409240
13	NC_018592	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409240
14	NC_018592	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409240
15	NC_018592	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409240
16	NC_018592	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409240
17	NC_018592	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	404409240
18	NC_018592	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409240
19	NC_018592	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409240
20	NC_018592	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	404409240
21	NC_018592	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409240
22	NC_018592	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409240
23	NC_018592	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	404409240
24	NC_018592	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404409240
25	NC_018592	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	404409240
26	NC_018592	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409240
27	NC_018592	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409240
28	NC_018592	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409240
29	NC_018592	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409240
30	NC_018592	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409240
31	NC_018592	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409240
32	NC_018592	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	404409240
33	NC_018592	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409240
34	NC_018592	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	404409240
35	NC_018592	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	404409240
36	NC_018592	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	404409240
37	NC_018592	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409240
38	NC_018592	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409240
39	NC_018592	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409240
40	NC_018592	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	404409240
41	NC_018592	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409240
42	NC_018592	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	404409240
43	NC_018592	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018592	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018592	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018592	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018592	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409241
48	NC_018592	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409241
49	NC_018592	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409241
50	NC_018592	AG	3	6	2073	2078	50 %	0 %	50 %	0 %	404409241
51	NC_018592	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409241
52	NC_018592	TCAA	2	8	2097	2104	50 %	25 %	0 %	25 %	404409241
53	NC_018592	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409241
54	NC_018592	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409241
55	NC_018592	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	404409241
56	NC_018592	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404409241
57	NC_018592	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	404409241
58	NC_018592	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	404409241
59	NC_018592	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409241
60	NC_018592	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	404409241
61	NC_018592	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409241
62	NC_018592	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	404409241
63	NC_018592	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409241
64	NC_018592	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409241
65	NC_018592	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409241
66	NC_018592	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404409241
67	NC_018592	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409241
68	NC_018592	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409241
69	NC_018592	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409241
70	NC_018592	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018592	T	8	8	3055	3062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018592	ATG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409242
73	NC_018592	ACA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409242
74	NC_018592	T	7	7	3162	3168	0 %	100 %	0 %	0 %	404409242
75	NC_018592	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409242
76	NC_018592	TTG	2	6	3234	3239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409242
77	NC_018592	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409242
78	NC_018592	T	7	7	3295	3301	0 %	100 %	0 %	0 %	404409242
79	NC_018592	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409242
80	NC_018592	GGT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409242
81	NC_018592	T	6	6	3420	3425	0 %	100 %	0 %	0 %	404409242
82	NC_018592	ATT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409242
83	NC_018592	CTT	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409242
84	NC_018592	GAT	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409242
85	NC_018592	CTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409242
86	NC_018592	ACC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404409242
87	NC_018592	T	6	6	3658	3663	0 %	100 %	0 %	0 %	404409242
88	NC_018592	TGT	2	6	3667	3672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409242
89	NC_018592	GCT	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409242
90	NC_018592	TAA	2	6	3900	3905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409242
91	NC_018592	CGG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404409242
92	NC_018592	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409242
93	NC_018592	TCC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404409242
94	NC_018592	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409242
95	NC_018592	TTA	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409242
96	NC_018592	TTTAT	2	10	4207	4216	20 %	80 %	0 %	0 %	404409242
97	NC_018592	TGT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409242
98	NC_018592	TTTGT	2	10	4328	4337	0 %	80 %	20 %	0 %	404409242
99	NC_018592	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409242
100	NC_018592	A	7	7	4437	4443	100 %	0 %	0 %	0 %	404409242
101	NC_018592	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409242
102	NC_018592	A	7	7	4476	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018592	T	7	7	4505	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018592	AATA	2	8	4513	4520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018592	C	6	6	4525	4530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_018592	A	7	7	4543	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018592	AT	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018592	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018592	A	7	7	4621	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018592	TGAT	2	8	4703	4710	25 %	50 %	25 %	0 %	404409243
111	NC_018592	TGG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409243
112	NC_018592	AACC	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	404409244
113	NC_018592	TGCT	2	8	5003	5010	0 %	50 %	25 %	25 %	404409244
114	NC_018592	TAT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409244
115	NC_018592	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409244
116	NC_018592	ATTT	2	8	5302	5309	25 %	75 %	0 %	0 %	404409244
117	NC_018592	CAA	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409244
118	NC_018592	TTCA	2	8	5464	5471	25 %	50 %	0 %	25 %	404409244
119	NC_018592	GCG	2	6	5488	5493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404409244
120	NC_018592	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409244
121	NC_018592	A	6	6	5603	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	404409244
122	NC_018592	AATC	2	8	5612	5619	50 %	25 %	0 %	25 %	404409244
123	NC_018592	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409244
124	NC_018592	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409244
125	NC_018592	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409244
126	NC_018592	TTC	3	9	5801	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409244
127	NC_018592	GAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409244
128	NC_018592	CGA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409244
129	NC_018592	ACA	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409244
130	NC_018592	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409244
131	NC_018592	A	7	7	5970	5976	100 %	0 %	0 %	0 %	404409244
132	NC_018592	TGA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018592	AAAG	2	8	6007	6014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018592	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018592	AGA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409245
136	NC_018592	TTG	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409245
137	NC_018592	TGA	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409245
138	NC_018592	GAAATT	2	12	6232	6243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404409245
139	NC_018592	A	6	6	6311	6316	100 %	0 %	0 %	0 %	404409245
140	NC_018592	GTC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409245
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150	NC_018592	CCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404409245
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152	NC_018592	GAT	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409245
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174	NC_018592	AAC	2	6	7799	7804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409245
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180	NC_018592	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_018592	A	6	6	10724	10729	100 %	0 %	0 %	0 %	404409247
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251	NC_018592	ACT	2	6	10866	10871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409247
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254	NC_018592	ATTA	2	8	11022	11029	50 %	50 %	0 %	0 %	404409247
255	NC_018592	ACA	2	6	11051	11056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409247
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261	NC_018592	TCCT	2	8	11584	11591	0 %	50 %	0 %	50 %	404409247
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265	NC_018592	TTGAT	2	10	11756	11765	20 %	60 %	20 %	0 %	404409247
266	NC_018592	GAG	2	6	11818	11823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404409247
267	NC_018592	GTG	2	6	11855	11860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409247
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269	NC_018592	ATG	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409247
270	NC_018592	CAT	2	6	12112	12117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409247
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402	NC_018592	TGG	2	6	18502	18507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409253
403	NC_018592	CTT	2	6	18565	18570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409253
404	NC_018592	A	6	6	18672	18677	100 %	0 %	0 %	0 %	404409253
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415	NC_018592	TCT	2	6	19143	19148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409253
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433	NC_018592	TTG	2	6	19986	19991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409255
434	NC_018592	GTT	2	6	20006	20011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409255
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437	NC_018592	TTCA	2	8	20093	20100	25 %	50 %	0 %	25 %	404409255
438	NC_018592	GCA	2	6	20180	20185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409255
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440	NC_018592	T	7	7	20304	20310	0 %	100 %	0 %	0 %	404409256
441	NC_018592	TAATT	2	10	20370	20379	40 %	60 %	0 %	0 %	404409256
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462	NC_018592	T	6	6	21312	21317	0 %	100 %	0 %	0 %	404409256
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464	NC_018592	GTT	2	6	21350	21355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409256
465	NC_018592	TAA	2	6	21359	21364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409256
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467	NC_018592	T	6	6	21427	21432	0 %	100 %	0 %	0 %	404409256
468	NC_018592	CTC	2	6	21433	21438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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470	NC_018592	A	6	6	21563	21568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_018592	ATT	2	6	21575	21580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_018592	GAG	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_018592	ATTAA	2	10	21887	21896	60 %	40 %	0 %	0 %	404409257
479	NC_018592	TGA	2	6	21961	21966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409257
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499	NC_018592	AAGC	2	8	22680	22687	50 %	0 %	25 %	25 %	404409257
500	NC_018592	GAA	2	6	22805	22810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409257

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